Africa-Places.com ने Cotonou में लगभग 12 विश्वविद्यालयों को सूचीबद्ध किया है। Cotonou के कुछ टॉप रेटेड विश्वविद्यालयों हैं। विश्वविद्यालय संस्थान "लेस कोर्ट्स सोनौ", ईएसपीएएम गठन विश्वविद्यालय, आईएससीजी बेनिन विश्वविद्यालय, ईएसजीटी बेनिन, ईसेप द शेफर्ड, ESCAE-बेनिन विश्वविद्यालय Cotonou परिसर, यूनिवर्सिटी ला हेग बेनिन, बेनिन के अफ्रीकी विश्वविद्यालय अकपाकपा परिसर, अफ्रीकन स्कूल ऑफ इकोनॉमिक्स & प्रबंधन के स्नातक स्कूल (ईएसएम)।